

La stazione di San Giovanni di Casarsa è situata a pochi passi dal centro di San Giovanni, la frazione più grande del comune di Casarsa della Delizia, da cui dista circa 1,5 km in direzione sud.
La stazione ha la particolarità di essere distante soltanto 1,666 km dal capolinea di Casarsa, una distanza che è la minima tra 2 stazioni in Friuli.
La stazione è impresenziata ed è dotata di un solo binario; inoltre, è composta soltanto da una tettoia ed una banchina dotata di pachine e bacheca.
Nella stazione fermano tutti i treni regionali e le autocorse sostitutive che circolano sulla linea ferroviaria Casarsa - Portogruaro.
Il flusso di passeggeri è mediocre e si concentra prevalentemente nelle ore di punta e nel periodo scolastico.
La stazione di San Giovanni di Casarsa, a differenza delle altre stazioni della linea ferroviaria in esercizio dal giorno dell'apertura della linea ferroviaria, è entrata in esercizio soltanto il 12 settembre 2005.
In occasione dell'inaugurazione, avvenuta il 27 agosto 2005, è stato fatto transitare per la prima volta sulla linea Casarsa - Portogruaro il primo e nuovo treno Minuetto a trazione diesel (il MD041) acquistato dalla regione Friuli-Venezia Giulia, entrato in esercizio qualche mese dopo.
Con la costruzione della stazione, è stata recuperata una piccola area di proprietà delle Ferrovie dello Stato che era rimasta per lungo tempo in stato di abbandono. Le opere sono state interamente finanziate e realizzate con fondi dell'amministrazione provinciale. La riqualificazione è stata impostata su interventi molto leggeri: la scelta dei materiali utilizzata per il rivestimento delle pareti del muro della pensilina per l'attesa dei viaggiatori risponde ad esigenze di integrazione con i segni ereditati dal passato. Il rivestimento esterno della struttura portante della copertura è stato realizzato da vecchi artigiani locali attraverso il riuso di sassi recuperati da una demolizione di un fabbricato a Prodolone di San Vito al Tagliamento. La copertura, invece, è stata realizzata in vetro stratificato con struttura portante costituita da profili in acciaio.
Via Runcis, in corrispondenza dell'ingresso al piazzale della stazione.
Nei punti vendita dei rivenditori autorizzati è possibile acquistare soltanto biglietti e abbonamenti ferroviari per treni regionali, con partenza limitata a 3 stazioni (una delle quali è la stazione più vicina al punto vendita) e con destinazione limitata a tutte le stazioni del triveneto.